Vanligvis ses hudsymptomer, gastrointestinale symptomer eller en kombinasjon av begge deler. Hvilke hudsymptomer som ses kan variere og de kan ikke skilles fra de som ses ved atopisk dermatitt. Når kløen ikke responderer på kortison bør en fôrallergi mistenkes (men en respons på kortison utelukker ikke at fôrallergi er årsaken).

Generalisert eller lokalisert, ikke sesongbetinget kløe (i ansiktet, i ører, på labber, i armhuler, i lysken og i perinealområdet) er det vanligste symptomet. Dyret vil klø, slikke og bite seg unormalt mye.

Det er mulig at en fôrallergi ikke utløser symptomer i seg selv fordi symptomene ikke overskrider kløeterskelen men at utbrudd skjer når andre miljøallergener tilkommer for eksempel under pollensesongen. Otitis externa og residiverende pyodermier med eller uten kløe kan ses ved fôrallergi.

Gastrointestinale symptomer kan omfatte oppkast, diare´, vekttap, magesmerter, flatulens og økt antall defekeringer (mer enn 3 per dag).